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    • Actividad de Raoultella sp. como entomopatógena de T. solanivora frente a: AHLs (N-acil homoserina lactonas), co-inoculaciones, una formulación preliminar y compatibilidad con insumos agrícolas. 

      Moreno Quintana, Diana Katherine; Obando León, María Camila (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá D.CBacteriología y Laboratorio Clínico, 2018-11)
      En Colombia el cultivo de papa se ve afectado por varias plagas, entre estas Tecia solanivora, causante de pérdidas económicas durante su producción, para combatir dicha plaga los agricultores utilizan insecticidas ...
    • Actividad promotora de crecimiento vegetal y biocontrolador de rizobacterias aisladas cultivo de papa. 

      Mosquera Salas, Yuliet Yaisa (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá, Distrito CapitalBacteriología y Laboratorio Clínico, 2019-12)
      La papa (Solanum Tuberosum ) es un alimento de consumo básico y considerado el eje fundamental de la economía local de 283 municipios y de los departamentos de Boyacá, Nariño y Cundinamarca. La producción de papa es afectada ...
    • Efecto de la inoculación de rizobacterias promotoras de crecimiento vegetal en plantas de papa criolla (Solanum Phureja). 

      Viasus Florez, Javier Alejandro; Rodriguez Largo, Ruben Dario (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá D.CBacteriología y Laboratorio Clínico, 2020)
      El uso de plaguicidas y fertilizantes es el método de elección del agricultor para controlar plagas y enfermedades, situación que termina deteriorando el suelo y bajando la productividad de un cultivo ya que influye ...
    • Efecto de la salinidad sobre el conteo de genes asociados a microorganismos de estrés ambiental en un manglar semiárido del departamento de la Guajira. 

      Bonilla Amaya, Hasbleidy; López Mosquera, Ensi Yaniari (Facultad de Ciencias de la SaludBogotáBacteriología y Laboratorio Clínico, 2022)
      Los manglares soportan diferentes tensiones por contaminación, nutrientes y fluctuantes cambios de oxígeno y salinidad. En zonas semiáridas, las tensiones se incrementan por los bajos niveles de precipitación, altas ...
    • Efecto de la salinidad sobre genes asociados a ciclos biogeoquímicos del manglar de la desembocadura del Río Ranchería, La Guajira. 

      Sandoval Figueredo, Angie Vanessa; Rodelo Bernal, María Camila (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá DCBacteriología y Laboratorio Clínico, 2019)
      Los suelos de manglar albergan una gran variedad de microorganismos claves en el ciclaje de nutrientes que actúan bajo variaciones estacionales y diarias de salinidad. Sin embargo, se desconoce cómo la salinidad influye ...
    • Efecto de la salinidad sobre la abundancia de genes asociados a la síntesis y resistencia de compuestos antimicrobianos en la desembocadura del río Ranchería en la Guajira. 

      Daza Giraldo, Libia Vanessa (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá DCBacteriología y Laboratorio Clínico, 2019-06)
      La salinidad en los manglares afecta la producción de metabolitos secundarios, los cuales son de interés biotecnológico como los compuestos antimicrobianos. Sin embargo, la información de la biosíntesis de metabolitos ...
    • Formulación preliminar de rizobacterias entomopatógenas de tecia solanivora insecto plaga de los tubérculos de papa (solanum tuberosum) 

      Guerra Lurán, Emmanuel José (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá, Distrito CapitalBacteriología y Laboratorio Clínico, 2019-12)
      Tecia solanivora es uno de los principales insectos plaga del cultivo de papa en Suramérica y Centroamérica. Una opción de control de este insecto es el uso de bioformulados que constan de un material transportador y un ...
    • Mitigación del estrés por sequía e inundación en plantas de tomate (Lycopersicum esculentum) por rizobacterias promotoras de crecimiento vegetal. 

      Montenegro Guzman, Paola Andrea; Morales Hernández, María Fernanda (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotáBacteriología y Laboratorio Clínico, 2019-06)
      Actualmente, la agricultura ecológica busca obtener productos biológicos que tengan efectos en la promoción de crecimiento de las plantas mediante diferentes mecanismos, mejorando las condiciones del suelo y aumentando ...
    • Potencial biotecnológico de rizobacterias procedentes de papa (Solanum tuberosum L) para la degradación de tres plaguicidas organofosforados y el herbicida 2,4-D. 

      Parada Calderón, Jenniffer Carolina; Pinzón Franco, Laura Yamile (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaUniversidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá D.C.Bacteriología y Laboratorio Clínico, 2020)
      El cultivo de papa es afectado por varias plagas, como insectos, hongos, bacterias y malezas. Su control depende, principalmente, de la aplicación de insecticidas, cuyos productos de degradación son persistentes y tóxicos ...

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      • Actividad de Raoultella sp. como entomopatógena de T. solanivora frente a: AHLs (N-acil homoserina lactonas), co-inoculaciones, una formulación preliminar y compatibilidad con insumos agrícolas.

        ...

        Vanegas Guerrero, Javier | 2018-11

        En Colombia el cultivo de papa se ve afectado por varias plagas, entre estas Tecia solanivora, causante de pérdidas económicas durante su producción, para combatir dicha plaga los agricultores utilizan insecticidas químicos, estos ocasionan daño al medio ambiente, toxicidad al agricultor, entre otros; es por ello, que surge la necesidad de buscar otras alternativas para el control de T. solanivora, entre ellas encontramos el control biológico mediante rizobacterias entomopatógenas productoras de AHLs. El objetivo de este trabajo es potenciar la actividad de Raoultella sp. como entomopatógena de T. solanivora mediante el uso de AHLs, co- inoculaciones, una formulación preliminar y compatibilidad con insumos agrícolas. Para esto, se determinó la producción de proteasas, ácido cianhídrico, sideróforos y movilidad tipo swarming de Raoultella sp, a través de, la adición de AHLs exógenas; de igual modo, se evaluó la viabilidad de Raoultella sp. en tres transportadores (turba, aserrín y líquido) mediante formulación, y se co-inoculó con una rizobacteria promotora de crecimiento vegetal y de AHLs. Además, se observó su resistencia frente a los insecticidas comerciales más utilizados en el control de T. solanivora. Los resultados obtenidos muestran que la producción de ácido cianhídrico, sideróforos y motilidad tipo swarming de Raoultella sp. aumentan al agregar las AHLs exógenas. El transportador que mejor mantuvo la viabilidad de Raoultella sp. fue turba a 4°C, de igual modo, ésta puede crecer en medios suplementados con insecticidas comerciales. De esta manera, se puede concluir Raoultella sp. es una gran alternativa de control biológico contra T. solanivora.

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      • Actividad promotora de crecimiento vegetal y biocontrolador de rizobacterias aisladas cultivo de papa.

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        Martinez Granados, Vilma Yamile | 2019-12

        La papa (Solanum Tuberosum ) es un alimento de consumo básico y considerado el eje fundamental de la economía local de 283 municipios y de los departamentos de Boyacá, Nariño y Cundinamarca. La producción de papa es afectada por diferentes patógenos como Rhizoctonia solani. Este patógeno produce perdidas en la cadena de producción superior al 20%. Una forma de controlar este patógeno es el uso de rizobacterias. El objetivo de este trabajo fue determinar la actividad biocontroladora y promotora de crecimiento vegetal de rizobacterias. Para esto se caracterizaron 66 rizobacterias y se evaluaron distintos mecanismos de acción como la producción de ácido cianhídrico, ácido indolacético, sideróforos, proteasas, solubilización de fosfato y crecimiento en medio libre de nitrógeno. Posteriormente, se seleccionaron seis rizobacterias que presentaron todos los mecanismos de acción para biocontrolar a R. solani y promover el crecimiento vegetal bajo invernadero. Cuatro asilamientos presentaron inhibición significativa contra R. solani. El aislamiento 59-A presentó la mayor actividad antagónica posiblemente por la capacidad de producir ácido cianhídrico, sideróforos y proteasas. Las rizobacterias no afectaron el crecimiento de plantas de papa. Esto resultados sugiere que las rizobacterias presentan un alto potencial como biocontroladores.

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      • Efecto de la inoculación de rizobacterias promotoras de crecimiento vegetal en plantas de papa criolla (Solanum Phureja).

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        Vanegas Guerrero, Javier | 2020

        El uso de plaguicidas y fertilizantes es el método de elección del agricultor para controlar plagas y enfermedades, situación que termina deteriorando el suelo y bajando la productividad de un cultivo ya que influye negativamente en la asimilación de nutrientes, disminuye la actividad microbiana en el suelo y su interacción con las plantas. Es necesario buscar alternativas amigables con el ambiente, y por ello, el objetivo del presente estudio fue evaluar la capacidad de las Rizobacterias Promotoras de Crecimiento en el desarrollo de plantas de papa criolla (Solanum phureja). Los ensayos fueron realizados con 15 cepas de rizobacterias que fueron aisladas del cultivo de papa del departamento de Boyacá, las cuales fueron inoculadas en las plantas de papa criolla con el fin de determinar cuáles de ellas promovían mejor el crecimiento, usando diferentes transportadores: ceniza volante, talco, roca fosfórica, caolín y almidón de maíz. Adicionalmente, se analizaron los mecanismos que podrían promover el crecimiento vegetal. Los resultados evidenciaron que las 15 rizobacterias estudiadas fueron capaces de promover el crecimiento de la planta, destacándose 4 de los aislamientos (3, 4, 6 y 10), que fueron positivos para los mecanismos de solubilización de fósforo, fijación de nitrógeno, producción de sideróforos y producción de ácido indolacético, características que evidencian su potencial actividad promotora de crecimiento vegetal. Con relación a los transportadores, los ensayos realizados con talco fueron los que presentaron la mejor promoción del crecimiento en papa criolla, con mezclas bacterianas (Tratamiento C3) y en forma individual (Cepa 10) al inducir la tuberización.

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      • Efecto de la salinidad sobre el conteo de genes asociados a microorganismos de estrés ambiental en un manglar semiárido del departamento de la Guajira.

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        Vanegas Guerrero, Javier | 2022

        Los manglares soportan diferentes tensiones por contaminación, nutrientes y fluctuantes cambios de oxígeno y salinidad. En zonas semiáridas, las tensiones se incrementan por los bajos niveles de precipitación, altas temperaturas y radiación. Los microorganismos de estos ecosistemas están adaptados a estas condiciones, sin embargo, son limitados los trabajos de metagenómica que han estudiado la presencia de estos genes en este ecosistema. El objetivo que persigue la presente investigación fue determinar el efecto de la salinidad sobre el recuento de genes asociados a proteínas de estrés en microorganismos de un manglar semiárido del departamento de la Guajira; para ello se obtuvieron muestras de suelo rizosférico concentradas en tres áreas con salinidades contrastantes en el (brazo Riito) del río Ranchería en la Guajira, el ADN total se extrajo y se secuenció mediante Illumina HiSeq 2500. Se detectaron 620 genes asociados a las rutas transportadoras ABC, quorum sensing, recombinación homóloga, sistema secreción bacteriana, respondedoras de estrés, base escisión de reparación (BER) y proteínas de choque térmico, de ellos UNG, ERCC3, XPB, ClpB, xseA, holA, livF estuvieron influenciados por la salinidad alta, GroES, HSPE1, clpA, tres a la media y recC, recA, ClpB, recC, proV a la baja, principalmente asociados a mecanismos de bases de escisión de reparación, choque térmico y reparación por escisión de nucleótidos respectivamente. Finalmente los resultados revelan la influencia de la salinidad sobre las rutas metabólicas que contribuyen a entender la dinámica funcional de proteínas de estrés ambiental del manglar.

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      • Efecto de la salinidad sobre genes asociados a ciclos biogeoquímicos del manglar de la desembocadura del Río Ranchería, La Guajira.

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        Vanegas Guerrero, Javier | 2019

        Los suelos de manglar albergan una gran variedad de microorganismos claves en el ciclaje de nutrientes que actúan bajo variaciones estacionales y diarias de salinidad. Sin embargo, se desconoce cómo la salinidad influye sobre la actividad funcional de los microorganismos del manglar. El objetivo de este trabajo fue determinar el efecto de la salinidad sobre genes asociados a ciclos biogeoquímicos Nitrógeno, Azufre y Metano en un manglar alterado de la Guajira por medio de un análisis metagenómico. Para esto se muestrearon tres puntos contrastantes en salinidad (H: 61,52 ‰, M: 14,61 ‰, L: 2,80 ‰), se extrajo el ADN total, se secuenció por Illumina HiSeq, se anotó con MEGAN 5 y se asignaron las secuencias con la base de datos KEGG. El análisis estadístico se realizó con la página web Microbiome Analyst y STAMP. Se encontró que los genes asociados al ciclo del Metano tuvieron las mayores abundancias, seguido de los genes del ciclo del N y S. El ciclo del Metano fue favorecido por la salinidad. Se detectaron más marcadores en salinidad alta entre los tres ciclos. Sin embargo, la salinidad baja favoreció la abundancia de glutamina sisntetasa (glnA) del ciclo del N, la salinidad media de sulfato adeniltransferasa (sat) del ciclo del S y la salinidad alta de la piruvato, agua dikinasa (pps) del ciclo del Metano. Los resultados revelan la influencia de salinidad sobre los ciclos biogeoquímicos y contribuyen a entender la dinámica funcional de los microorganismos del manglar.

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      • Efecto de la salinidad sobre la abundancia de genes asociados a la síntesis y resistencia de compuestos antimicrobianos en la desembocadura del río Ranchería en la Guajira.

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        Vanegas Guerrero, Javier | 2019-06

        La salinidad en los manglares afecta la producción de metabolitos secundarios, los cuales son de interés biotecnológico como los compuestos antimicrobianos. Sin embargo, la información de la biosíntesis de metabolitos secundarios, la resistencia microbiana y el efecto de la salinidad en la expresión de los genes en los ecosistemas de manglar es limitada. El objetivo principal de este trabajo fue determinar el efecto de la salinidad sobre la abundancia de genes asociados a la síntesis y resistencia de compuestos antimicrobianos presentes en el suelo rizosférico utilizando metagenómica y bioinformática. Por medio de la extracción de ADN, se secuenciaron en la plataforma Illumina HiSeq y análisis de los datos utilizando la plataforma web MicrobiomeAnalyst y STAMP. Se encontró que las abundancias de genes presentaron diferencias significativas en relación con los gradientes de salinidad baja, media y alta de la comunidad bacteriana del manglar en la desembocadura del Río Ranchería y se estableció la diversidad funcional de los genes con actividad antimicrobiana y la resistencia de estas, siendo Streptomycin biosynthesis la vía más abundante asociada a la síntesis de antimicrobianos en los tres puntos de salinidad y el gen más abundante K01710 (E4.2.1.46, rfbB, rffG; dTDP-glucose 4,6-dehydratase) igualmente en los tres puntos de salinidad.

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      • Formulación preliminar de rizobacterias entomopatógenas de tecia solanivora insecto plaga de los tubérculos de papa (solanum tuberosum)

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        Acero Godoy, Jovanna | 2019-12

        Tecia solanivora es uno de los principales insectos plaga del cultivo de papa en Suramérica y Centroamérica. Una opción de control de este insecto es el uso de bioformulados que constan de un material transportador y un agente biológico como rizobacterias entomopatógenas. En este estudio, se realizó una bioformulación preliminar con tres transportadores (turba, roca fosfórica y ceniza volante). La metodología incluyó: verificación de la viabilidad bacteriana de tres rizobacterias, con los transportadores roca fosfórica, ceniza volante y turba, por 90 días además de la evaluación del crecimiento bacteriano en un medio mínimo evaluando diferentes concentraciones de glucosa y tres fuentes de carbono y la medición del potencial de las rizobacterias para la protección y disminución del daño ocasionado por T. solanivora y promoción del crecimiento al tubérculo. Se encontró que en los tres transportadores las rizobacterias preservaron la biomasa a los treinta días, siendo la turba, el transportador con los mayores recuentos y mejor conservación de la viabilidad de las rizobacterias. Después de este tiempo, se observó un descenso de la biomasa hasta los noventa días. La dextrosa al 5% fue el mejor tratamiento para el crecimiento bacteriano. De las rizobacterias estudiadas, TN110 fue la que mejor protegió al tubérculo del ataque de T. solanivora, seguido de C47 y TN106, en sí, ninguna de las rizobacterias promovió el crecimiento. Se concluye que, una bioformulación que contenga turba y TN110 pude ser una buena alternativa para el control de larvas de T. solanivora.

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      • Mitigación del estrés por sequía e inundación en plantas de tomate (Lycopersicum esculentum) por rizobacterias promotoras de crecimiento vegetal.

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        Vanegas Guerrero, Javier | 2019-06

        Actualmente, la agricultura ecológica busca obtener productos biológicos que tengan efectos en la promoción de crecimiento de las plantas mediante diferentes mecanismos, mejorando las condiciones del suelo y aumentando la productividad de las cosechas. El objetivo de este trabajo fue determinar la mitigación del estrés por sequía e inundación en plantas de tomate (Lycopersicum esculentum) por rizobacterias promotoras de crecimiento vegetal (PGPR). Para esto de forma inicial se seleccionaron rizobacterias con actividad promotora de crecimiento vegetal en plantas de tomate, posterior a esto se determinó el crecimiento de plantas de tomate al ser inoculadas y sometidas a estrés de sequía e inundación, por último, se comparó la actividad enzimática en suelos con y sin estrés hídrico. Plántulas de tomate fueron inoculadas con quince rizobacterias. Luego de 31 días, ocho aislamientos presentaron aumentos en peso seco de raíz hasta siete veces con respecto al control. El aislamiento LZ30 presentó la mayor actividad arilsulfatasa con un 80,39%. Mientras, el aislamiento LZ10 presentó la mayor actividad fosfatasa ácida y alcalina con un 32,04% y 340,13%. Bajo condiciones de estrés por sequía, los aislamientos LZ5, LZ7, LZ6 LZ62 y LZ63 incrementaron en peso seco de raíz entre el 52-142% con respecto al control no inoculado. El aislamiento LZ6 presentó la mayor actividad fosfatasa ácida y alcalina, con un 309% y 247,96%. Mientras, bajo condiciones de inundación los aislamientos LZ4, LZ38, LZ2, LZ5 y LZ3 presentaron aumentos en peso seco de raíz entre el 50- 78% con respecto al control. El aislamiento LZ4 presentó la mayor actividad fosfatasa ácida (284,63%) y LZ5 la mayor actividad alcalina (345,19%). Estos resultados demuestran que la inoculación de PGPR permite un adecuado crecimiento de los cultivos Lycopersicum esculentum bajo condiciones de estrés por sequía e inundación y aumentan la actividad microbiana en el suelo.

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      • Potencial biotecnológico de rizobacterias procedentes de papa (Solanum tuberosum L) para la degradación de tres plaguicidas organofosforados y el herbicida 2,4-D.

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        Vanegas Guerrero, Javier | 2020

        El cultivo de papa es afectado por varias plagas, como insectos, hongos, bacterias y malezas. Su control depende, principalmente, de la aplicación de insecticidas, cuyos productos de degradación son persistentes y tóxicos para el hombre, animales y el medio ambiente. Se ha demostrado que estos pueden ser degradados mediante el uso de rizobacterias. El objetivo de este trabajo fue determinar la degradación de tres plaguicidas organofosforados y el herbicida 2,4-D utilizando rizobacterias de papa. Se seleccionaron dos bacterias por su capacidad de crecer en medio mínimo de sales utilizando como única fuente de carbono plaguicidas. Se realizó la búsqueda de genes y enzimas asociados a la degradación de compuestos xenobióticos de los dos aislamientos seleccionados. Se aplicó la metodología COT y HPLC para detectar la degradación de los plaguicidas. La cinética de crecimiento mostró que Raoultella terrigena C47 y Enterobacter asburiae TN152 utilizan los plaguicidas como única fuente de carbono, debido a que tienen genes que están asociados a la degradación de insecticidas. La enzima citocromo P450 fue detectada tanto en C47 como TN152, específica para el metabolismo y degradación de clorpirifos. Mediante la técnica de HPLC se comprobó la degradación de clorpirifos por parte de R. terrigena C47. Estos resultados demuestran que las rizobacterias aisladas de papa tienen el potencial de degradar los compuestos en estudio. Se espera a futuro que estos microorganismos puedan implementarse en técnicas de biorremediación y poder llevar el diseño experimental a mayor escala, para el tratamiento directo de los productos de degradación de estos contaminantes.

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