Efecto de la salinidad sobre el conteo de genes asociados a microorganismos de estrés ambiental en un manglar semiárido del departamento de la Guajira.

Vanegas Guerrero, Javier | 2022

Los manglares soportan diferentes tensiones por contaminación, nutrientes y fluctuantes cambios de oxígeno y salinidad. En zonas semiáridas, las tensiones se incrementan por los bajos niveles de precipitación, altas temperaturas y radiación. Los microorganismos de estos ecosistemas están adaptados a estas condiciones, sin embargo, son limitados los trabajos de metagenómica que han estudiado la presencia de estos genes en este ecosistema. El objetivo que persigue la presente investigación fue determinar el efecto de la salinidad sobre el recuento de genes asociados a proteínas de estrés en microorganismos de un manglar semiárido del departamento de la Guajira; para ello se obtuvieron muestras de suelo rizosférico concentradas en tres áreas con salinidades contrastantes en el (brazo Riito) del río Ranchería en la Guajira, el ADN total se extrajo y se secuenció mediante Illumina HiSeq 2500. Se detectaron 620 genes asociados a las rutas transportadoras ABC, quorum sensing, recombinación homóloga, sistema secreción bacteriana, respondedoras de estrés, base escisión de reparación (BER) y proteínas de choque térmico, de ellos UNG, ERCC3, XPB, ClpB, xseA, holA, livF estuvieron influenciados por la salinidad alta, GroES, HSPE1, clpA, tres a la media y recC, recA, ClpB, recC, proV a la baja, principalmente asociados a mecanismos de bases de escisión de reparación, choque térmico y reparación por escisión de nucleótidos respectivamente. Finalmente los resultados revelan la influencia de la salinidad sobre las rutas metabólicas que contribuyen a entender la dinámica funcional de proteínas de estrés ambiental del manglar.